Стажер службы инновационного развития биоинформатики в ЮниРусь Санкт-Петербург

Стажер-биоинформатик в инновационную команду. Молекулярное моделирование, поиск активных ингредиентов, работа с базами данных и научной литературой.

Задачи:

• молекулярное моделирование
• моделирование взаимодействия пептид-мишень
• поиск новых биологически активных ингредиентов, технологий
• работа с базами данных
• работа с научной литературой

Требования:

• выпускник последнего курса бакалавриата, 1-2 курс магистратуры по специальности: биоинформатика или молекулярная биология, Information Technology, Data Science, математика, биотехнология, медицина, биология
• знания в области структурной биологии
• знание основ Python: работа с Jupyter Notebooks, умение автоматизировать вычислительные эксперименты: подготовку, запуск вычислительных задач и анализ полученных данных
• опыт применения какого-либо из следующих методов: молекулярный докинг, молекулярная динамика, фармакофорный скрининг, квантовохимические вычисления свойств органических соединений
• знание основных библиотек для работы с данными (numpy, pandas) и с химией (rdkit)
• умение работать со структурами биомолекул в каком-нибудь из инструментов для визуализации: Pymol, VMD, UCSF Chimera или другом
• умение представить результаты работы команде и описать последовательность действий для воспроизведения результатов
• знание английского языка на уровне intermediate
• умение работать в условиях многозадачности/самостоятельности

Условия:

• творческая проектная работа с поддержкой опытного наставника
• временный контракт от 3 месяцев с возможностью продления
• гибкий рабочий график и возможность совмещения стажировки с учебой
• развитие в гибкой, современной и динамичной команде
• возможность на практике применить полученные знания, став частью команды Арнест ЮниРусь

Навыки:

• Python
• Jupyter Notebooks
• numpy
• pandas
• rdkit
• Pymol
• VMD
• UCSF Chimera