В каком формате удобнее работать

JSON - наиболее удобный формат для работы в Java благодаря простоте, читаемости и широкой поддержке библиотек. Он легко конвертируется в Java-объекты с помощью Jackson или Gson:

// Пример работы с JSON в Java
ObjectMapper mapper = new ObjectMapper();
User user = mapper.readValue(jsonString, User.class);
String json = mapper.writeValueAsString(user);

Преимущества:

• Человекочитаемый
• Поддержка встроена в Spring и другие фреймворки
• Гибкость (можно игнорировать неизвестные поля)
• Быстрая сериализация/десериализация

Для конфигураций иногда используют YAML (более компактный), а для высоконагруженных систем - бинарные форматы (Protocol Buffers, Avro).