От какого класса происходят checked исключения

Checked исключения в Java наследуются от класса Exception, но не от RuntimeException. Они обязательны к обработке либо через try-catch, либо через объявление в сигнатуре метода с throws.

Пример:

public void readFile() throws IOException { // checked исключение
    FileReader file = new FileReader("test.txt");
}

В отличие от unchecked исключений (наследников RuntimeException), checked исключения проверяются на этапе компиляции.