Почему не стоит использовать System.exit

System.exit завершает работу JVM немедленно, что может привести к неожиданным последствиям:

• Неочищенные ресурсы: Финализаторы и try-finally блоки не выполняются.
• Тестирование сложнее: Юнит-тесты могут падать, если код вызывает exit.
• Проблемы в контейнерах: В сервлетах или Spring Boot это может нарушить graceful shutdown.

Лучше использовать исключения или управление жизненным циклом приложения:

// Плохо:
if (error) System.exit(1);

// Лучше:
if (error) throw new RuntimeException("Critical error");

В Spring Boot можно использовать ApplicationContext.close(), а в сервлетах — корректные коды ответов.